Protein–RNA interactions for Protein: E2RYF7

HCG22, Protein PBMUCL2, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG22E2RYF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HCG22E2RYF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HCG22E2RYF7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HCG22E2RYF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HCG22E2RYF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HCG22E2RYF7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HCG22E2RYF7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HCG22E2RYF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms