Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBD1B2RD01 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CENPBD1B2RD01 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CENPBD1B2RD01 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CENPBD1B2RD01 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBD1B2RD01 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CENPBD1B2RD01 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CENPBD1B2RD01 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CENPBD1B2RD01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CENPBD1B2RD01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CENPBD1B2RD01 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBD1B2RD01 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPBD1B2RD01 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms