Protein–RNA interactions for Protein: A8MV23

SERPINE3, Serpin E3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINE3A8MV23 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINE3A8MV23 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SERPINE3A8MV23 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SERPINE3A8MV23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SERPINE3A8MV23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SERPINE3A8MV23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINE3A8MV23 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINE3A8MV23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINE3A8MV23 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINE3A8MV23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINE3A8MV23 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINE3A8MV23 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINE3A8MV23 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINE3A8MV23 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINE3A8MV23 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINE3A8MV23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINE3A8MV23 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINE3A8MV23 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINE3A8MV23 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SERPINE3A8MV23 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SERPINE3A8MV23 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERPINE3A8MV23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERPINE3A8MV23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SERPINE3A8MV23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SERPINE3A8MV23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SERPINE3A8MV23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms