Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU0

RFPL4A, Ret finger protein-like 4A, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4AA6NLU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RFPL4AA6NLU0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RFPL4AA6NLU0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFPL4AA6NLU0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFPL4AA6NLU0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFPL4AA6NLU0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RFPL4AA6NLU0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFPL4AA6NLU0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFPL4AA6NLU0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFPL4AA6NLU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFPL4AA6NLU0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFPL4AA6NLU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RFPL4AA6NLU0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RFPL4AA6NLU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFPL4AA6NLU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFPL4AA6NLU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFPL4AA6NLU0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms