Protein–RNA interactions for Protein: A2RUU4

CLPSL1, Colipase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSL1A2RUU4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPSL1A2RUU4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLPSL1A2RUU4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLPSL1A2RUU4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPSL1A2RUU4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLPSL1A2RUU4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLPSL1A2RUU4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPSL1A2RUU4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLPSL1A2RUU4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPSL1A2RUU4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLPSL1A2RUU4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPSL1A2RUU4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLPSL1A2RUU4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLPSL1A2RUU4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLPSL1A2RUU4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLPSL1A2RUU4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CLPSL1A2RUU4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLPSL1A2RUU4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPSL1A2RUU4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLPSL1A2RUU4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLPSL1A2RUU4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms