Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM89A2RUT3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM89A2RUT3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM89A2RUT3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM89A2RUT3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM89A2RUT3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM89A2RUT3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM89A2RUT3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM89A2RUT3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM89A2RUT3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM89A2RUT3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM89A2RUT3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM89A2RUT3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM89A2RUT3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM89A2RUT3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM89A2RUT3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM89A2RUT3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM89A2RUT3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM89A2RUT3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM89A2RUT3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms