Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV2A0A0J9YWF9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV2A0A0J9YWF9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRBV2A0A0J9YWF9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV2A0A0J9YWF9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRBV2A0A0J9YWF9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV2A0A0J9YWF9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV2A0A0J9YWF9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV2A0A0J9YWF9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV2A0A0J9YWF9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV2A0A0J9YWF9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV2A0A0J9YWF9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV2A0A0J9YWF9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV2A0A0J9YWF9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV2A0A0J9YWF9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV2A0A0J9YWF9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV2A0A0J9YWF9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV2A0A0J9YWF9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV2A0A0J9YWF9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV2A0A0J9YWF9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRBV2A0A0J9YWF9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRBV2A0A0J9YWF9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRBV2A0A0J9YWF9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms