Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ABI3Q9P2A4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms