Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TRIM23P36406 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms