Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC9A1P19634 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC9A1P19634 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms