Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NDUFB1-202ENST00000553514 454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SPINK4-201ENST00000379721 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC098591.1-202ENST00000507914 937 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PCTP-202ENST00000325214 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TACR1-202ENST00000409848 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AL391097.1-201ENST00000432706 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFTRP13569 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PRY-201ENST00000303728 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PRY2-201ENST00000303804 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 PRYP3-201ENST00000343584 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AL359094.2-201ENST00000420941 750 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC009312.1-201ENST00000457110 592 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 RN7SL483P-201ENST00000478417 285 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 AC124944.3-201ENST00000607976 1304 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFTRP13569 NBEAP3-201ENST00000420638 1493 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms