Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 CLUHP8-201ENST00000547527 1485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SOD1-202ENST00000389995 865 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 PEBP1P1-201ENST00000554856 510 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SERPINE3-203ENST00000521255 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 OR6M1-201ENST00000309154 1053 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 PLPP4-201ENST00000369073 1135 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SSSCA1-203ENST00000526877 713 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLA1P09884 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
POLA1P09884 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 COX4I2-201ENST00000376075 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AL669831.4-201ENST00000447500 872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AL391822.1-201ENST00000452580 562 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AC103706.1-201ENST00000561761 679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 SNRPD2-203ENST00000585392 379 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 FAM231B-201ENST00000600179 510 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLA1P09884 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 ECM1-203ENST00000369049 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLA1P09884 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms