Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 DNMT3A-202ENST00000321117 4279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 TBX3-201ENST00000257566 4208 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MYRIPQ8NFW9 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms