Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF827Q17R98 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF827Q17R98 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF827Q17R98 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF827Q17R98 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF827Q17R98 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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ZNF827Q17R98 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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ZNF827Q17R98 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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ZNF827Q17R98 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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ZNF827Q17R98 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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ZNF827Q17R98 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF827Q17R98 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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