Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PDE2A-218ENST00000540345 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CUL3Q13618 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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