Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ITGA6P23229 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGA6P23229 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms