Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GIPC1O14908 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms