Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms