Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHP1Q99653 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHP1Q99653 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHP1Q99653 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHP1Q99653 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHP1Q99653 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHP1Q99653 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHP1Q99653 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHP1Q99653 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHP1Q99653 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHP1Q99653 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHP1Q99653 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHP1Q99653 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CHP1Q99653 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHP1Q99653 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms