Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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