Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRSF5Q13243 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRSF5Q13243 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms