Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HNRNPLP1-201ENST00000421896 1501 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
MCCD1P59942 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms