Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MCAMP43121 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MCAMP43121 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1008 ms