Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SRRM4A7MD48 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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