Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PLVAPQ9BX97 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms