Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP5P45974 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP5P45974 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP5P45974 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms