Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRIM5Q9C035 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRIM5Q9C035 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms