Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRRTQ9BXP5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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