Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
COG3Q96JB2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
COG3Q96JB2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms