Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RFNG-202ENST00000429557 994 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SIRT1Q96EB6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IL1RN-205ENST00000409930 848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 NMNAT3-212ENST00000511444 873 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms