Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPPQ6IPU0 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPPQ6IPU0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms