Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTJ3

KLHDC7A, Kelch domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC7AQ5VTJ3 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHDC7AQ5VTJ3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHDC7AQ5VTJ3 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms