Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITGAEP38570 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms