Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RSPH1-202ENST00000398352 937 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 FAM138A-201ENST00000417324 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 GAPDHP29-201ENST00000429913 985 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SYS1-DBNDD2-202ENST00000452133 674 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 RN7SL148P-201ENST00000467120 279 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 FAM138D-201ENST00000504074 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 FAM138E-201ENST00000507796 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 PRDX2P3-201ENST00000515779 586 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AL352977.2-201ENST00000557101 547 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 HFE-205ENST00000352392 653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC092284.1-201ENST00000511386 1289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GLI3P10071 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GLI3P10071 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 CLDN10-AS1-201ENST00000416909 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MLN-202ENST00000430124 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 RPS9-213ENST00000626547 476 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GLI3P10071 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms