Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CICP19-201ENST00000632944 2357 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 WDR27-203ENST00000448612 3178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 GMEB2-201ENST00000266068 4559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNFSF18Q9UNG2 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms