Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
TRIM8Q9BZR9 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms