Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SGCZQ96LD1 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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