Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTF3C6Q969F1 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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GTF3C6Q969F1 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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