Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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