Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SYT1P21579 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SYT1P21579 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SYT1P21579 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms