Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FRMD3A2A2Y4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms