Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms