Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms