Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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