Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 DZIP1L-201ENST00000327532 3493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
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LINC01545Q5VT33 BCL2L13-214ENST00000543133 4975 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 BCL2L13-217ENST00000618481 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 RIOK3-201ENST00000339486 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC01545Q5VT33 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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