Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
JAG1P78504 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms