Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIP4K2AP48426 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PIP4K2AP48426 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms