Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CYP2C9P11712 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP2C9P11712 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms