Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
HKR1P10072 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
HKR1P10072 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms