Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ASIC1P78348 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms